(特別の機関)
・地方創生推進事務局
・知的財産戦略推進事務局
・科学技術・イノベーション推進事務局
・健康・医療戦略推進事務局
・宇宙開発戦略推進事務局
・北方対策本部
・総合海洋政策推進事務局
・金融危機対応会議
・孤独・孤立対策推進本部
・高齢社会対策会議
・中央交通安全対策会議
・犯罪被害者等施策推進会議
・消費者政策会議
・国際平和協力本部
・日本学術会議
・官民人材交流センター
・食品ロス削減推進会議
・原子力立地会議
(外局)
・公害等調整委員会
・消防庁
(特別の機関)
・中央選挙管理会
・政治資金適正化委員会
・自治紛争処理委員
(外局)
・出入国在留管理庁
・公安審査委員会
・公安調査庁
(特別の機関)
・検察庁
(特別の機関)
・在外公館
(外局)
・国税庁
(外局)
・スポーツ庁
・文化庁
(特別の機関)
・日本学士院
・地震調査研究推進本部
・火山調査研究推進本部
・日本ユネスコ国内委員会
(外局)
・中央労働委員会
(特別の機関)
・死因究明等推進本部
・自殺総合対策会議
・中央駐留軍関係離職者等対策協議会
(外局)
・林野庁
・水産庁
(特別の機関)
・農林水産技術会議
・食育推進会議
・農林水産物・食品輸出本部
・木材利用促進本部
(外局)
・資源エネルギー庁
・特許庁
・中小企業庁
(外局)
・観光庁
・気象庁
・運輸安全委員会
・海上保安庁
(特別の機関)
・国土地理院
・小笠原総合事務所
・自転車活用推進本部
・海難審判所
(外局)
・原子力規制委員会
(特別の機関)
・公害対策会議
(外局)
・防衛装備庁
(特別の機関)
・防衛会議
・幕僚監部
・自衛隊
・情報本部
・防衛監察本部
・外国軍用品審判所
・駐留軍等再編関連振興会議