ナンバリングの対象は、高速自動車国道などで構成される「高規格幹線道路」、高規格幹線道路を補完し地域の道路ネットワークを担う「地域高規格道路」、および高規格幹線道路から主要な空港や港湾・観光地へのアクセスを担う道路、および首都圏・名古屋圏の環状道路です。首都高や阪神高速などの「都市高速道路」のナンバリングとは別となります。
原則として英字＋数字（＋A）で表され、英字部分は高速道路（Expressway）の頭文字「E」または環状（Circle）の「E」を用います。数字部分は、並行する国道の番号を付番を基本とし、使用できる国道番号がない場合は自治体コードに基づいて付番します。付加するAは、並行するナンバリング高速道路と並行し、同一グループであることを示す符号となっています。
東名高速道路・名神高速道路
新東名高速道路・伊勢湾岸自動車道・新名神高速道路
山陽自動車道
中国自動車道・関門橋
九州自動車道
南九州自動車道
東北自動車道
東北縦貫自動車道八戸線
北海道縦貫自動車道
北海道横断自動車道
常磐自動車道・仙台東部道路・三陸沿岸道路・仙台北部道路
日本海東北自動車道・秋田自動車道
北陸自動車道
京都縦貫自動車道・山陰近畿自動車道・山陰自動車道
東九州自動車道・宮崎自動車道
徳島自動車道・高松自動車道・松山自動車道
東北中央自動車道
京葉道路・館山自動車道・富津館山道路
横浜新道・横浜横須賀道路
関越自動車道
上信越自動車道
中央自動車道・長野自動車道
中央自動車道
東名阪自動車道・伊勢自動車道
京奈和自動車道
名阪国道・西名阪自動車道
近畿自動車道・阪和自動車道
舞鶴若狭自動車道
神戸淡路鳴門自動車道
播磨自動車道・中国自動車道・鳥取自動車道
瀬戸中央自動車道
広島呉道路
徳島自動車道・高知自動車道
大分自動車道・長崎自動車道・ながさき出島道路
西九州自動車道
北海道横断自動車道根室線
旭川紋別自動車道
東海北陸自動車道・能越自動車道
近畿自動車道紀勢線
北海道横断自動車道根室線
三陸沿岸道路
釜石自動車道・東北自動車道・秋田自動車道
仙台南部道路・東北自動車道・山形自動車道
磐越自動車道
北関東自動車道・東水戸道路・常陸那珂有料道路
東関東自動車道
新東名高速道路清水連絡路・中部横断自動車道・中央自動車道
尾道自動車道・松江自動車道
徳島南部自動車道・阿南安芸自動車道・高知東部自動車道
四国横断自動車道・松山自動車道
沖縄自動車道・那覇空港自動車道
函館江差自動車道
帯広広尾自動車道
北海道横断自動車道網走線
深川留萌自動車道
日高自動車道
津軽自動車道
新空港自動車道
首都圏中央連絡自動車道（圏央道）
中部縦貫自動車道・東海北陸自動車道
中央自動車道富士吉田線・東富士五湖道路
新東名高速道路引佐連絡路
三遠南信自動車道
伊豆縦貫自動車道
関西空港自動車道・関西国際空港連絡橋
北近畿豊岡自動車道
岡山自動車道・中国自動車道・米子自動車道
広島自動車道・中国自動車道・浜田自動車道
東広島呉自動車道
尾道福山自動車道・西瀬戸自動車道（瀬戸内しまなみ海道）・今治小松自動車道
九州中央自動車道
東九州自動車道
あぶくま高原道路
日光宇都宮道路
千葉東金道路
第三京浜道路・横浜新道
新湘南バイパス・西湘バイパス
小田原厚木道路
のと里山海道
知多半島道路・知多横断道路・中部国際空港連絡道路（セントレアライン）
京滋バイパス
第二京阪道路
堺泉北道路
南阪奈道路・大和高田バイパス
第二阪奈道路
第二神明道路
第二神明道路（北線）（神戸西バイパス）
播但連絡道路
長崎バイパス
日出バイパス・大分空港道路
一ツ葉有料道路（南線）
東京外環自動車道（外環道）
首都圏中央連絡自動車道（圏央道）
東京湾横断道路（東京湾アクアライン）・東京湾横断道路連絡道（東京湾アクアライン連絡道）
名古屋第二環状自動車道（名二環）
東海環状自動車道